当世界遇到麻烦时，人们又一次召来了绝密特工。卡门-科尔特斯(Carmen Cortez，亚历克斯-维加饰，Alexa Vega)和朱尼-科尔特斯(Juni Cortez，达瑞尔-萨巴拉饰，Daryl Sabara)又出现在《非常小特务2：梦中岛》(“Spy Kids 2: The Island Of Lost Dreams”)的另一次冒险之旅中。

他们最新的任务是前往一个神秘小岛，在那里他们将会碰上一位疯狂的遗传学科学家(史蒂夫-布塞米饰，Steve Buscemi)以及他所发明的新奇生物，还将与科学家复制的“非常小特务”的对手们----加里-吉莱斯(Gary Giggles，马特-奥利里饰，Matt O‘Leary)和格蒂-吉莱斯(Gerti Giggles，埃米莉-奥斯蒙饰，Emily Osment)在内的敌对力量作战。

谁知他们正落入一个圈套，此举将对每个“科尔特斯”特工，从他们的超级间谍老爸、老妈到他们的间谍祖父母(里卡多-蒙塔尔班饰，Ricardo Montalban；霍兰-泰勒饰，Holland Taylor)发出挑战。这个夏天，卡门和朱尼将要执行如此重大的任务，他们肯定要将全家牵涉进去。